有时候WILLE能够留下来完全是因为他们的存在就是NERV计划的一部分，甚至就连他们信赖的王牌——明日香和真希波，也只是备用品兼祭品罢了。
残缺的箱根，第一试验场。
如同海浪般的潮汐声在这里响起。
赤色的液体浸湿碇真嗣的皮靴，对于这里碇真嗣不会陌生，因为曾经在这里，是他和初号机的第一次相遇。
此时呈现在他眼前的是一个暗红色的蛋壳。
蛋壳内部传来不可思议的巨声，仿佛束缚着雷霆，湿热的狂风从蛋壳破裂处冲了出来，十几秒钟后，沛然的红色液体从蛋壳内部喷涌而出，撞击在天花板上化为血雨沥沥而下。如同蛋壳般的粉红色椭圆外壳破裂，一尊与初号机十分相识的机体缓缓从水中升起。
“最后的执行者终于完成了啊。”冬月幸增感慨万分的看着眼前的光景，有种目睹神明降世的神圣感觉。
蛋壳内部的液体泛着白沫，它的温度接近于人的体温，颜色是血一般的赤红。
碇源堂仍旧站在边缘处的平台上，默默地看着十三号机诞生的画面，十字瞳孔中空荡荡的，什么东西都没有。
随着一道灯光落在后方来者的身上，他也转过身凝视着比预期更早三分钟抵达这里的碇真嗣。
“好，这样所有的工具都已经准备好了。”碇源堂居高临下的看着站在灯光下的碇真嗣，“先带上这个。”
此时一道黑红色的物品被他丢到碇真嗣的面前，碇真嗣低头捡起它。正是出现在渚薰，真希波，明日香脖颈处的东西，DSS项圈。
“去驾驶十三号机，拔掉莉莉丝身上的长枪，这样你还有重新回到过去的机会。”
“那入侵到总部的WILLE怎么办？”碇真嗣问。
“这个不需要你来关系，而且这里也不是总部了。”
可就在话音落下的瞬间，震耳欲聋的响声再度于外侧响起，PrbnowBox区域彻底塌陷，被机体撞毁的蛋白壁让两个空间连接到一起。
只见赤红的二号机和黄色的九号机从天而降，相拥着坠落到地面，如果忽略掉对于彼此间致命的攻击，就仿佛最为热恋的情侣。
如果没有三号机的暴走，或许明日香和绫波丽还能继续做朋友吧。可惜，没有如果。
随后数十只藏青色的小型人造使徒扑到二号机改的身上，犹如链锁般的物体将祂的身躯紧紧束缚。有人造使徒的帮助的九号机终于起身，拔出身后装甲处的高振动粒子刀，毫不犹豫地插进二号机的腹部。
在这一刻，结果已经很明显——
NERV成功对反叛的WILLE施加制裁。
一六五：倔强坚持，对抗时间
低沉的闷哼在机体内响起，碇真嗣眉头微蹙。声音从驾驶舱传播到外界已经发生几番改变，带着强忍着疼痛的坚毅，让他感觉有几分陌生。
但九号机内部的绫波丽并没有留手，她仍然在机械的执行命令。九台量产型犹如藏青色的钢钉般死死的束缚着二号机的关节，绫波丽再度拔出二号机携带的高震动粒子刀，毫无怜悯的凶狠刺下，再旋转拉开。
二号机的血液从伤口里冲了出来，化作巨大的瀑布，颜色是截然不同的褐紫。这一刀破坏了她的备用电源，此时的二号机除非发生类似于初号机的暴走，否则只能彻底沦陷在这座敌人的老巢。
九号机安静的站在二号机的边缘，驾驶舱中的绫波丽默默地看着这场惨剧，没有任何表情。瞳孔中空荡荡的，好像与她无关。
灯光从头顶照了下来，这一次却是再度落在碇源堂的身上。这个重新戴上墨镜的男人平淡的挥了挥手，示意绫波丽可以把这个捣乱的家伙拖下去。但就在这个时候，碇真嗣却发出轻笑，“有意思。”他小声的说。
碇源堂眉头微蹙，他不知道碇真嗣这个时候笑什么，难道是见到曾经的朋友相互厮杀，导致神经错乱吗？
可是下一秒，震耳欲聋的枪声从更高处的控制室里响起。
骤然响起的枪声让碇源堂完全来不及展开领域，一瞬间他新戴上的墨镜连同后面的天灵感都被完全轰烂。
“好久不见了，司令。”熟悉的凌冽声音从高处响起，“赤木博士让我向你问好。”
这时众人才看清站在的身影，红色的飞鸟站在中央控制室的边缘处，目光凌厉的看着被打穿天灵盖的碇源堂。
——式波·明日香·兰格雷。
“你早就知道里面的驾驶员不是这位第二适格者？”渚薰看到明日香的出现，有些诧异，侧目看着旁边的碇真嗣。
“适格者并不是多么稀缺的资质，真正罕见的是优秀的驾驶员。”碇真嗣变相回答渚薰的问题。
碇源堂捡起地上的墨镜，可是已经破碎到不能使用。这时他才看向头顶的上方的身影。
“先开枪，后提问……你比以前变的更干脆了呢，第二适格者。”碇源堂说，“居然能够在箱根内部畅通无阻，有人给你后门了吧。”
这时他的目光从眼前的女人身上挪开，侧目看着渚薰。他首先怀疑的对象是这位使徒。
从计划开始实行，他就总是出现意外。碇源堂怀疑，他已经洞悉到自己告知他的计划中错误的部分，已经选择带着碇真嗣背离自己的道路。
“大概是有太多人看你不顺眼吧，在回到箱根之后我的权限居然也恢复了。虽然我不信教，但我很喜欢一句话；不讲者无信可言，不守盟约者无正教操守。你早就该下地狱了，碇源堂！”明日香冷冷的开口，把弹匣插入枪里，分别上膛，双手十字交叉，双枪放在肩头上，抬起枪射击。
枪声不间断的响起，看着子弹也不间断的轰击在碇源堂的身上，直到身躯支离破碎。
但即便如此，明日香也没有半点大意，直到另一处的墙壁再度破裂，一尊粉色的机体在量产型的围剿下冲出围栏，朝着支离破碎的碇源堂投掷出灰色的长枪。
一瞬间，来不及恢复的碇源堂就被灰色的朗基鲁斯之枪贯穿到地面，他有些错愕的看着贯穿自己身躯的灰色长枪，正是眼前的物体约束着祂身体的恢复。
“朗基鲁斯之枪的复制品，同样可以直接贯穿绝对领域并有效杀伤使徒的武器，虽然不如原品那般神圣，但你也并非是使徒。”真希波嘲讽的声音在试验场中响起。
“这样啊。”碇源堂看着自己如同蜘蛛网般破裂的身躯，“真是可惜了。”
即便如此，他仍然能够以最平静的态度扭头看向碇真嗣，“原来是你。”
在最后时刻，他终于意识到问题根源不是WILLE，也不是渚薰，而是眼前的碇真嗣。
脚下摇摇欲坠的箱根，眼前是被贯穿胸膛的父亲，但悠然自得的微笑却可得知，这些都占据不了他的思绪。尽管死亡与破坏的危机近在咫尺，他的笑容丝毫没有变化。
眼前的碇真嗣，绝对不是他所熟知的十四年前的少年。
他没有再多说话了，仍由维系着形体的绝对领域崩解，此时隐藏在“壳”之下的本质也终于显露出来。
此时不知道是谁重新恢复的权限，让希望之舰的三贤者系统奇迹般的链接到MGAI的局域网，同时也看到此时在第一试验场发生的画面。
此时于壳之下的外表，是纯粹由神性组成的能量洪流。即便舍弃有绝对领域束缚的形体，仍然能够以人类的身份，漂浮到十三号机的上空。
“他已经是无法用常理来理解的存在，还是晚了一步啊。”真希波叹了口气。
“虽然是无法用常理来理解，但可以拆分来理解他不同的组成部分。他已经不需要受绝对领域约束的肉体来生存，有着属于使徒的特性，仍然保留着人类的身份。”在第一试验场的渚薰同样说道。
“在他躯体破碎的瞬间，可以看到他的内部空空如也，并没有脏器血液神经的存在。但是他同样还是人类。恐怕在很早之前他就已经完成这一步，并且将自己的灵魂献祭给十三号机。”
随着碇源堂所化身的能量洪流汇聚到十三号机的口腔，而这尊酷似初号机的机体猛然睁开猩红的眼眸。
另一处，铭刻着生命之树的半通明平台上，消失的冬月幸增出现在这里。他同样通过MAGI的转播看到如今十三号机苏醒的画面，但脸庞上并没有露出任何喜色。
“缺失最关键的两个驾驶员，很难让十三号机完成超越初号机的3+觉醒啊，碇源堂。”